Genetik: Datenbank Unknome listet unbekannte Gene
Gene enthalten die Baupläne für das Leben. Von vielen Gene ist aber die Funktion unbekannt. Das wollen Wissenschaftler aus Großbritannien ändern - mit Hilfe einer öffentlich zugänglichen Datenbank.
Unknome(öffnet im neuen Fenster) haben die Forscher die Datenbank genannt - ein Kofferwort aus Unkown und Genome, also unbekanntes Genom. Ziel ist es, wenig untersuchte, aber potenziell wichtige Proteine und die Gene, die diese kodieren, zu identifizieren. Die Hoffnung der Initiatoren ist, dass diese untersucht werden.
"Das menschliche Genom kodiert etwa 20.000 Proteine, von denen viele noch nicht beschrieben sind" , schreibt das Team um den Molekularbiologen Sean Munro im Open-Access-Magazin Plos Biology(öffnet im neuen Fenster) . "Es hat sich gezeigt, dass sich die wissenschaftliche Forschung in der Regel auf gut untersuchte Proteine konzentriert, was zu der Sorge führt, dass schlecht verstandene Gene zu Unrecht vernachlässigt werden."
Die Datenbank enthält Proteine aus menschlichem Erbgut
Unknome enthält über 13.000 Gruppen und fast zwei Millionen Proteine. Proteine werden nach Familien geordnet, die einen gemeinsamen Vorfahren haben. Die Datenbank enthält alle Proteinfamilien mit mindestens einem Protein, das im menschlichen Erbgut oder in dem von elf anderen häufig untersuchten Organismen vorkommt.
In der Datenbank wird jeder Gruppe von Proteinen ein Bekanntheitswert zugewiesen, der anzeigt, wie viel über die entsprechenden Gene bekannt ist. Etwa 3.000 dieser Gruppen haben einen Wert von Null. Darunter sind rund 800, die mindestens ein menschliches Protein enthalten. Das zeigt, dass auch über das menschliche Genom vieles noch unbekannt ist.
Dass die Gene in der Datenbank nicht ohne Bedeutung sind, hat das Team selbst nachgewiesen: Sie untersuchten 260 wenig bekannte Gene, die sowohl im Genom des Menschen als auch in dem von Fruchtfliegen vorkommen. Sie schalteten die proteinkodierenden Gene nacheinander in den Fruchtfliegen aus. Dabei zeigte sich, dass etwa 60 davon lebenswichtig sind: Nachdem sie ausgeschaltet wurden, waren die Versuchstiere nicht mehr lebensfähig. Ob diese Gene eine ähnliche Bedeutung für den Menschen haben, ist noch unbekannt.